Kết quả giải mã gen chuỗi ca mắc COVID-19 trong cộng đồng ở TPHCM

Theo kết quả giải mã nhanh bộ gene của SARS-CoV-2 thì bệnh nhân (BN) 4583 ở quận 7 mang biến chủng B.1.617.2 của Ấn Độ, còn BN 4780 ở quận 3 mang biến chủng B.1.1.7 của Anh.

Lấy mẫu xét nghiệm COVID-19 tại chung cư ở TP Thủ Đức có ca mắc COVID-19 (ảnh: HCDC)

Ngày 21/5, TS.BS Nguyễn Văn Vĩnh Châu - Giám đốc Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới TPHCM cho biết, nhóm nghiên cứu COVID-19 của Bệnh viện và Đơn vị Nghiên cứu Lâm Sàng Đại Học Oxford đã tiến hành giải mã nhanh bộ gene của SARS-CoV-2 từ bệnh nhân BN 4583 (ngụ quận 7 qua điều tra dịch tễ học được cho là có liên quan đến BN 4514 và chùm ca TP Thủ Đức ghi nhận hôm 18/5) và BN 4780 (trong chùm ca ở quận 3 ghi nhận ngày 20/5).

Theo BS Châu, nhóm nghiên cứu đã sử dụng mẫu RNA được tách chiết từ mẫu dịch phết hầu họng của 2 bệnh nhân, thực hiện giải mã gene bằng kỹ thuật Illumina MiSeq và MinION, dùng phần mềm lắp ghép bộ gene Genious, định danh biến chủng bằng phần mềm Pangolin và tìm đột biến bằng phần mềm COV-GLUE.

Lần đầu tiên TPHCM ghi nhận sự lưu hành đồng thời của cả hai biến chủng Anh và Ấn Độ trong cộng đồng

Kết quả xác định đột biến bằng COV-GLUE cho thấy các bộ gene thu nhận chứa các đột biến tiêu biểu của biến chủng B.1.1.7 và biến chủng B.1.617.2 tương ứng.

Từ kết quả trên, nhóm nghiên cứu kết hợp với thông tin dịch tễ và kết luận rằng 2 bệnh nhân BN 4583 (quận 7) và BN 4514 (quận Thủ Đức - đã báo cáo kết quả giải mã ngày 19/5) có cùng một nguồn lây do biến chủng B.1.617.2 (biến chủng Ấn Độ).

Bệnh nhân 4780 (quận 3) nhiễm biến chủng B.1.1.7. Biến chủng B.1.1.7 (biến chủng Anh) đang lưu hành tại Đà Nẵng và Hà Nam, hiện nay đã lây lan ra các tỉnh khu vực miền Trung; cũng đã phát hiện được trên BN 1660 (từ Hải Dương, xác định ngày 29/1) và BN2910 (từ Hà Nam ngày 29/4) được cách ly điều trị tại Bệnh viện Dã Chiến Củ Chi trước đây.

Như vậy đây là lần đầu tiên TPHCM ghi nhận sự lưu hành đồng thời của cả hai biến chủng được cho là có khả năng lây lan nhanh (biến chủng Ấn Độ và biến chủng Anh) ở các ca bệnh trong cộng đồng.

Nguồn: [Link nguồn]Nguồn: [Link nguồn]