Thủ môn Nguyễn Filip không may tái phát chấn thương háng ở phút 72 trong trận Công an Hà Nội hòa Macarthur FC 1-1 tại lượt trận thứ ba vòng bảng AFC Champions League Two 2025/26 hôm 23-10. Ban đầu, anh được dự đoán sẽ phải nghỉ thi đấu từ 6 đến 8 tuần để hồi phục hoàn toàn.
Chấn thương này khiến Nguyễn Filip không thể góp mặt trong đợt tập trung đội tuyển Việt Nam cũng như vắng mặt ở nhiều trận đấu quan trọng của Công an Hà Nội. Anh dự kiến trở lại vào giữa tháng 11, bỏ lỡ ít nhất ba trận tiếp theo của đội bóng thủ đô.
Tuy nhiên, theo thông tin mới nhất, Nguyễn Filip có thể hồi phục nhanh hơn dự kiến. Nguồn tin mới nhất cho biết anh chỉ cần khoảng 2 tuần để trở lại, tùy vào tình hình thực tế và quyết định của HLV Mano Polking về việc sử dụng anh trong các trận đấu tới.